Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc10Q3TLI0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc10Q3TLI0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms