Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bop1P97452 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms