Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhoP15409 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhoP15409 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhoP15409 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhoP15409 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhoP15409 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhoP15409 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhoP15409 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RhoP15409 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RhoP15409 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms