Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb3P09026 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb3P09026 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms