Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rabep1O35551 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabep1O35551 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabep1O35551 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabep1O35551 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabep1O35551 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabep1O35551 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabep1O35551 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabep1O35551 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabep1O35551 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms