Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna3O08545 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms