Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm11236J3QMS7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm11236J3QMS7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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