Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc8E9PWG2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc8E9PWG2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms