Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms