Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx6Q9ER75 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms