Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Subh2bvQ9D9Z7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms