Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933402E13RikQ9D4D2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933402E13RikQ9D4D2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms