Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gps1Q99LD4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms