Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NipblQ6KCD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms