Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 905.1 ms