Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdc1Q5PSV9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms