Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41P48193 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41P48193 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.6 ms