Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Kdm5cP41230 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kdm5cP41230 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kdm5cP41230 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 411.9 ms