Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa10P31310 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms