Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhoP15409 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RhoP15409 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhoP15409 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhoP15409 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhoP15409 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RhoP15409 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms