Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna3O08545 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms