Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4aF8VPX6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms