Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx7F8VPJ6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms