Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf1B2RRD7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms