Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a3A2ACT7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms