Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 455.2 ms