Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Knop1Q9Z2Q2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Knop1Q9Z2Q2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms