Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubl3Q9Z2M6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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