Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stx12Q9ER00 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx12Q9ER00 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms