Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms