Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gps1Q99LD4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gps1Q99LD4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms