Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc30Q8BVF4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms