Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcl3Q8BVF2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms