Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2surpQ6NV83 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2surpQ6NV83 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.1 ms