Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NipblQ6KCD5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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