Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knl1Q66JQ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knl1Q66JQ7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms