Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrmsQ62270 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms