Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd1Q61345 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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