Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mdc1Q5PSV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mdc1Q5PSV9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdc1Q5PSV9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms