Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc10Q3TLI0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc10Q3TLI0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms