Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdr16c6Q05A13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdr16c6Q05A13 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms