Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa10P31310 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa10P31310 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms