Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb3P09026 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb3P09026 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms