Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rfx7F8VPJ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx7F8VPJ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms