Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a3A2ACT7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms