Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdfS4R2K0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdfS4R2K0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdfS4R2K0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PdfS4R2K0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdfS4R2K0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms