Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr4Q9Z1L2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syngr4Q9Z1L2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngr4Q9Z1L2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngr4Q9Z1L2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr4Q9Z1L2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr4Q9Z1L2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms