Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vax2Q9WTP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vax2Q9WTP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax2Q9WTP9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax2Q9WTP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vax2Q9WTP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms