Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn7Q9R1S8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn7Q9R1S8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn7Q9R1S8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn7Q9R1S8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn7Q9R1S8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Capn7Q9R1S8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn7Q9R1S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn7Q9R1S8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn7Q9R1S8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn7Q9R1S8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn7Q9R1S8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms