Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb2Q9R1P3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb2Q9R1P3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb2Q9R1P3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb2Q9R1P3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb2Q9R1P3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms